Proses fermentasi makanan memiliki beberapa keuntungan seperti meningkatkan kemananan makanan karena proses fermentasi menghambat pertumbuhan patogen. Karenanya, makanan menjadi lebih aman untuk dikonsumsi. Selain itu, proses fermentasi juga dapat mengawetkan makanan melalui penghambatan asam organik seperti asam laktat, asam asetat, asam propianat dan lain-lain. Hal ini membuat makanan menjadi lebih awet.
Makanan yang difermentasi seringkali mengandung gizi yang lebih banyak dan kaya akan probiotik yang manfaatnya dikaitkan dengan kesehatan yang lebih baik. Probiotik yang dihasilkan selama fermentasi dapat membantu mengembalikan keseimbangan bakteri baik di usus dan dapat meringankan beberapa masalah pencernaan.
Namun, keuntungan proses fermentasi makanan bukan hanya terbatas pada hal tersebut. Proses fermentasi juga dapat meningkatkan nilai gizi makanan dan membuat cita rasa serta aroma menjadi lebih menarik.